يمتد ساحل البحر المتوسط المصري من رفح، عند الحدود المصرية مع قطاع غزة، إلى السلوم، عند الحدود المصرية الليبية، بمسافة 1200 كم. وفي المنطقة الشاطئية، تنحدر الأرض بدرجات متفاوتة، من موقع لآخر، على طول خط الشاطئ المتوسطي. وعلى ذلك، فإن المياه تصل إلى عمق مائة متر على أبعاد متفاوتة من هذا الخط، فتصل إليه قريباً جداً من الشاطئ في الجزء الغربي؛ وتزداد المسافة تدريجياً كلما اتجهنا شرقاً، حتى يكون عمق المائة متر أبعد ما يكون عن خط الشاطئ في بورسعيد؛ وبعدها، تعود المسافة بين الشاطئ وهذا العمق لتضيق مرة أخرى. ويرد ذلك إلى المخروط الطيني المترسب في منطقة مصب نهر النيل، أمام الدلتا.

     وبصفة عامة، يتأثر محتوى المياه الساحلية من النباتات والحيوانات بالعمق، وبدرجة توفر مصادر الغذاء الأساسي، وهي مصادر محدودة في تلك المنطقة، مما جعلها لا تتمتع بتنوع أحيائي كبير، مقارنةً بالبحر الأحمر. وعلى أي حال، يتوزع على طول القاع الغربي من الساحل المتوسطي المصري مروج متسعة من بعض أنواع الأعشاب البحرية، أهمها عشب ( بوسيدونيا أوشيانيكا )، مختلطاً بها بعض أنواع الطحالب البنية، من جنس ( سارجاسام )، بالإضافة إلى أنواع عديدة من الطحالب الحمراء والخضراء. والمعروف أن للأعشاب البحرية دوراً حيوياً مؤثراً كمستنبت أو حاضنة لصغار الكائنات البحرية، في مواسم تكاثرها؛ وهي أيضاً طعام مجموعة متنوعة من فقاريات البحر ولافقارياته؛ وأهم آكلي هذه الأعشاب السلحفاة الخضراء، وهي النوع الوحيد بين السلاحف البحرية نباتية الطعام.

     وتتأثر الكائنات القاعية، أو الطاعمات القاعيات، إلى حد كبير، بطبيعة القاع، فإذا كان طينياً أو رملياً، ناسب أنواعاً بعينها من الجلدشوكيات، والرخويات، والديدان عديدة الأشواك؛ وإذا غلبت فيه الطبيعة الصخرية، سكنته أنواع مختلفة عن هذه.

     والثابت، أن تنوع اللافقاريات البحرية في الجزء الجنوبي الشرقي من حوض البحر المتوسط منخفض نسبياً، غير أن هذه المجموعة من الحيوانات تضم أنواعاً عديدة من الرخويات ( أكبر الطوائف في المياه الشاطئية )، ومن الجلدشوكيات، وأيضاً من الديدان عديدة الأشواك ( وهي أكبر الطوائف في المياه العميقة )؛ وبالإضافة إلى هذه الطوائف الرئيسية، توجد أنواع من لافقاريات أخرى، كالأشنات الحيوانية، أو ( البرايوزوا )، والقشريات، والإسفنج، الذي تعرف المياه المتوسطية المصرية أربعة أنواع اقتصادية منه، هي : ( الفنجان التركي)، و ( أذن الفيل )، و ( الزيموكا )، و ( قرص العسل ).

     ويفتقر البحر المتوسط للشعاب المرجانية الحقيقية، ولكنه الموطن لعديد من أنواع الأشنات الحيوانية، وهي عبارة عن حيوانات دقيقة الحجم، طولها أقل من الملليمتر الواحد، وتوجد مستقرة أو ( جالسة )، ويميل معظم أنواعها للتجمع في مستعمرات تفترش أسطح أي جسم صلب مغمور، مثل حطام السفن الغارقة، وخطوط الاتصالات الممتدة على القاع، والصخور؛ ومنها أنواع تصنع فيما بينها تكوينات تحاكي النباتات، عبارة عن صفائح قائمة، لها اسم عام، هو ( شعاب الدانتيللا ).

     وتشتمل قائمة فقاريات مياه البحر المتوسط المصرية على أكثر من 350 نوعاً سمكياً، من بينها 43 نوعا غير أصيلة، مصدرها مياه المحيطين الهندي والهادي، هاجرت إلى المتوسط عبر قناة السويس؛ وبين هذه الأسماك أنواع عديدة عالية القيمة الاقتصادية، مثل أسماك المرجان، وأنواع البوري، والوقاريات. أما الفقاريات اللبونية المسجلة في مياه البحر المتوسط المصرية، فثمانية أنواع؛ ويمكن أن نضيف إليها الفقمة نادرة الوجود، المعروفة باسم ( الراهب ) Monk Seal ؛ التي يعتقد أنها تتواجد في بعض المواقع التي تجدها مناسبة لمعيشتها، إلى الغرب من مرســـى مطروح، والتي ترى – من حين لآخر – أمام الساحل الليبي، بالقرب من الحدود مع مصر.

     ومن البرمائيات، تعرف مياه المنطقة ثلاثة أنواع من السلاحف البحرية، هي ( الخضراء )، و ( كبيرة الرأس، أو البلهاء )، و ( جلدية الظهر )؛ وتزور الأوليان الشاطئ المصري، بشكل متقطع، لوضع البيض؛ أما الأخيرة، فغير معروف عنها قيامها بذلك، وهي الأكثر ندرةً بين الأنواع الثلاثة.